Nature:全新致癌机制,相分离驱动间歇性染色质成环,促进癌症发展

2021-11-01 09:26 来源:东莞妇科医院

肺癌的发展与核酸核酸内在无序区如前所述(IDR)的基因组极度都和。各种核酸(包则有mRNA表征、核仁调节剂和RNA相辅相成酶)中的的IDR通过尿液-尿液比方说(LLPS)产生孕育质,冲击从细胞器产生和兴奋耐受到基因组mRNA的无数生质操作过程。

是非的尿液-尿液比方说(LLPS)是常指糅合两个不方面遗传基因组的操作过程。该操作过程时有发生在肝细胞内,并能够产生有着各种质理特普遍性的如前所述,这些如前所述可以作出贡献肺癌,例如急普遍性脑癌的时有发生发展。在急普遍性脑癌中的,核孔酶(NUP98或NUP214)的反复等位基因易位产生了一种极度糅合微,它总是保留核孔酶 IDR——苯丙氨酸和氨基酸残基(FG)的串联分散每一次碱基。然而,IDR如何造成基因组误解调控和时有发生尚不可信。

2021年6月23日,北卡罗莱纳所大学教堂山分校 Gang Greg Wang 开发团队等 Nature 发表文章了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的研究课题论文。

该研究课题说明了比方说是肺癌产生的马达因素,肺癌通过比方说获取等位基因以组织一起诱发mRNA表征孕育质,这同时弱化了它们的核酸核酸普遍性并在再生操作过程中的其会极度三维核仁结构设计的产生。该研究课题是最先将比方说与肺癌产生联系一起的研究课题之一。因为在其他恶普遍性中的观察到了类似的基因组糅合,文章中的阐明的程序也可以断言其他类型的肺癌。

NUP98–HOXA9举例来说两个核酸基序和一个相辅相成碱基。为了研究课题NUP98-IDR在脑癌时有发生中的的发挥作用,研究课题开发团队主要使用摇动除了相辅相成碱基的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们挖掘出,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于摧毁相-比方说孕育微的化学质质)执行敏感。制备的NUP98-IDR(N-IDR)酶在胃产生尿液微孕育质。

为了大幅度分析报告FG每一次碱基对孕育质产生的浓度缺少普遍性和多价普遍性的重要普遍性,研究课题开发团队制备了成份不同数量FG每一次碱基的改组N-IDR核酸。他们挖掘出N-IDR举例来说38个或36个FG以浓度缺少普遍性的方法每一次产生的尿液滴,那些举例来说27个或11个FG的却不会进行比方说。确实NUP98–HOXA9中的的IDR以价缺少和浓度缺少的方法组织一起LLPS。

NUP98–HOXA9通过相似性结构设计如前所述与DNA相辅相成,造成脑癌时有发生操作过程中的的基因组痉挛。接下来,研究课题开发团队通过核仁免疫沉淀和高通量核酸来分析报告IDR抑制的比方说对NUP98–HOXA9核仁核酸普遍性的冲击。

调查结果, N-IDRWT/A9有着显着弱化的核酸占有率,而与无监督聚类下定义的振幅亚类都是。此外,宽而密集的超弱化子样峰是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和脑癌方面基因组富集。

为了大幅度分析报告IDR其会的LLPS在嵌合微核仁核酸中的的发挥作用,他们借助于了遗传学和医学的方法,说明了IDR抑制的LLPS在弱化嵌合mRNA表征核酸普遍性全面性的缘起发挥作用,与此相关超弱化子样峰处注意到的那些。确实IDR弱化糅合微的核酸相辅相成并且弱化靶基因组转录。

为了的测试NUP98–HOXA9通过LLPS产生核仁可逆的灵活性,研究课题开发团队生成了表示N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞的Hi-C研究课题成果,说明了了DNA可逆和粘贴两者之间的相对于方面普遍性。

为了已确定N-IDRWT/A9对Hi-C注意到频谱的冲击,他们聚集了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9表示细胞中的500个最强烈的N-IDRWT/A9占据核苷酸两者之间的相互发挥作用除此以外。调查结果,N-IDRWT/A9可逆以基本上与CTCF都是的方法产生,与比方说马达程序原则上。另外,N-IDRWT/A9特异普遍性可逆再度直达弱化子和靶基因组两者之间的直达,全力支持了糅合mRNA表征的IDR通过比方说在超弱化子样靶标和恶性肿瘤两者之间其会DNA可逆的看法。

综上所述,该研究课题挖掘出NUP98–HOXA9中的成份的LLPS活普遍性IDR对脑癌的时有发生和致恶性肿瘤表示程序的转录至关重要。这些effect由IDR的灵活性抑制:1)弱化mRNA表征与核酸靶标的相辅相成;2)作出贡献弱化子和恶性肿瘤启动子两者之间的陆上可逆。

该研究课题提供了一个诱发等位基因的原理普遍性确凿,该等位基因在再生操作过程中的作出贡献LLPS马达的mRNA表征相辅相成和3D核仁改组。由于则有IDR的LLPS活普遍性分子可与国际上的肺癌有关,该研究课题阐明的程序也可以断言其他类型的肺癌。

原始引自:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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